| 1 | - | | 32 | Katusha Team | 11:12:02 |
| 2 | (1) | | 30 | Movistar Team | + 07 |
| 3 | (1) | | 35 | Movistar Team | + 08 |
| 4 | (1) | | 33 | Euskaltel - Euskadi | + 21 |
| 5 | (4) | | 29 | Katusha Team | + 31 |
| 6 | (2) | | 36 | Geox - TMC | " |
| 7 | (3) | | 33 | Geox - TMC | + 36 |
| 8 | (3) | | 28 | Euskaltel - Euskadi | + 39 |
| 9 | (3) | | 30 | Saur - Sojasun | + 40 |
| 10 | (3) | | 23 | Orbea Continental | + 41 |
| 11 | (6) | | 30 | Geox - TMC | + 54 |
| 12 | (6) | | 29 | Movistar Team | + 01:01 |
| 13 | (3) | | 26 | FDJ | " |
| 14 | (7) | | 38 | Acqua & Sapone | + 01:10 |
| 15 | (13) | | 27 | Movistar Team | + 01:17 |
| 16 | (3) | | 31 | Movistar Team | + 01:26 |
| 17 | (10) | | 26 | Saur - Sojasun | + 01:31 |
| 18 | (4) | | 27 | Euskaltel - Euskadi | + 01:39 |
| 19 | (7) | | 25 | Andalucia Caja Granada | + 01:48 |
| 20 | (5) | | 25 | Saur - Sojasun | + 01:52 |
| 21 | (3) | | 21 | Geox - TMC | + 01:54 |
| 22 | (9) | | 24 | Acqua & Sapone | + 02:06 |
| 23 | (3) | | 20 | FDJ | + 02:08 |
| 24 | (2) | | 28 | Katusha Team | + 02:11 |
| 25 | (15) | | 27 | Skil - Shimano | + 02:29 |
| 26 | (2) | | 25 | Colombia es Pasion - Cafe de Colombia | + 02:39 |
| 27 | (1) | | 23 | Colombia es Pasion - Cafe de Colombia | + 02:41 |
| 28 | (1) | | 26 | FDJ | + 02:44 |
| 29 | (3) | | 25 | Topsport Vlaanderen - Mercator | + 02:51 |
| 30 | (9) | | 29 | Andalucia Caja Granada | " |
| 31 | (3) | | 30 | Katusha Team | + 02:55 |
| 32 | (3) | | 29 | Katusha Team | + 03:01 |
| 33 | - | | 29 | Colombia es Pasion - Cafe de Colombia | + 03:04 |
| 34 | (2) | | 21 | Burgos 2016 - Castilla y Leon | + 03:18 |
| 35 | (19) | | 20 | Skil - Shimano | + 03:20 |
| 36 | (2) | | 31 | Euskaltel - Euskadi | + 03:27 |
| 37 | (5) | | 32 | Topsport Vlaanderen - Mercator | + 03:37 |
| 38 | (5) | | 30 | Geox - TMC | + 03:40 |
| 39 | (5) | | 32 | Geox - TMC | + 03:41 |
| 40 | (5) | | 31 | Androni Giocattoli | + 03:42 |
| 41 | (9) | | 21 | Androni Giocattoli | + 03:56 |
| 42 | (21) | | 25 | Caja Rural | + 04:01 |
| 43 | (4) | | 24 | Topsport Vlaanderen - Mercator | + 04:04 |
| 44 | (9) | | 21 | Androni Giocattoli | + 04:08 |
| 45 | (19) | | 32 | Acqua & Sapone | + 04:20 |
| 46 | (24) | | 24 | Caja Rural | + 04:28 |
| 47 | (1) | | 22 | Colombia es Pasion - Cafe de Colombia | + 04:29 |
| 48 | - | | 37 | Katusha Team | + 04:39 |
| 49 | (2) | | 24 | Geox - TMC | + 04:40 |
| 50 | (6) | | 23 | Androni Giocattoli | + 05:04 |
| 51 | (24) | | 25 | Saur - Sojasun | + 05:07 |
| 52 | (19) | | 25 | Andalucia Caja Granada | + 05:19 |
| 53 | (28) | | 20 | Caja Rural | + 05:25 |
| 54 | (23) | | 27 | Skil - Shimano | + 05:30 |
| 55 | (28) | | 31 | Euskaltel - Euskadi | + 05:40 |
| 56 | (19) | | 25 | Orbea Continental | + 05:46 |
| 57 | (9) | | 39 | FDJ | + 05:58 |
| 58 | (9) | | 28 | Colombia es Pasion - Cafe de Colombia | + 06:15 |
| 59 | (26) | | 23 | Skil - Shimano | + 06:35 |
| 60 | (24) | | 25 | Caja Rural | + 06:40 |
| 61 | (30) | | 35 | Andalucia Caja Granada | + 06:42 |
| 62 | (28) | | 27 | Saur - Sojasun | + 06:43 |
| 63 | (23) | | 22 | Skil - Shimano | + 06:47 |
| 64 | (5) | | 27 | Caja Rural | + 06:48 |
| 65 | (14) | | 22 | Caja Rural | + 06:50 |
| 66 | (25) | | 42 | Caja Rural | + 06:57 |
| 67 | (6) | | 26 | Androni Giocattoli | " |
| 68 | (20) | | 24 | Skil - Shimano | + 07:02 |
| 69 | (14) | | 29 | Topsport Vlaanderen - Mercator | + 07:07 |
| 70 | (33) | | 22 | Orbea Continental | + 07:14 |
| 71 | (2) | | 21 | Euskaltel - Euskadi | + 07:25 |
| 72 | (10) | | 26 | Saur - Sojasun | + 07:26 |
| 73 | (7) | | 34 | Androni Giocattoli | + 07:30 |
| 74 | (16) | | 21 | Movistar Team | + 07:44 |
| 75 | (1) | | 22 | Burgos 2016 - Castilla y Leon | + 07:52 |
| 76 | (24) | | 29 | Acqua & Sapone | + 07:53 |
| 77 | (5) | | 21 | Geox - TMC | + 08:02 |
| 78 | (21) | | 20 | Burgos 2016 - Castilla y Leon | + 08:10 |
| 79 | (16) | | 23 | Orbea Continental | + 08:16 |
| 80 | (12) | | 32 | Colombia es Pasion - Cafe de Colombia | " |
| 81 | (17) | | 30 | Acqua & Sapone | + 08:17 |
| 82 | (22) | | 37 | Acqua & Sapone | " |
| 83 | (22) | | 38 | Acqua & Sapone | + 08:19 |
| 84 | (59) | | 29 | Andalucia Caja Granada | + 08:20 |
| 85 | (7) | | 28 | FDJ | + 08:30 |
| 86 | (21) | | 28 | Burgos 2016 - Castilla y Leon | + 08:32 |
| 87 | (57) | | 25 | Movistar Team | + 08:35 |
| 88 | (1) | | 34 | Euskaltel - Euskadi | + 09:22 |
| 89 | - | | 23 | Orbea Continental | + 09:29 |
| 90 | (7) | | 22 | Skil - Shimano | + 09:32 |
| 91 | (15) | | 22 | Burgos 2016 - Castilla y Leon | + 09:38 |
| 92 | (17) | | 40 | Androni Giocattoli | + 09:53 |
| 93 | (12) | | 21 | Orbea Continental | + 09:59 |
| 94 | (2) | | 37 | Colombia es Pasion - Cafe de Colombia | + 10:00 |
| 95 | (8) | | 21 | Euskaltel - Euskadi | + 10:04 |
| 96 | (3) | | 28 | Colombia es Pasion - Cafe de Colombia | " |
| 97 | (11) | | 27 | FDJ | + 10:05 |
| 98 | (16) | | 28 | Acqua & Sapone | " |
| 99 | (2) | | 24 | FDJ | + 10:07 |
| 100 | (6) | | 25 | Caja Rural | + 10:38 |
| 101 | (3) | | 23 | Burgos 2016 - Castilla y Leon | + 11:55 |
| 102 | (9) | | 22 | Orbea Continental | " |
| 103 | (7) | | 21 | Andalucia Caja Granada | + 12:10 |
| 104 | (2) | | 21 | Saur - Sojasun | + 12:18 |
| 105 | (11) | | 26 | Skil - Shimano | + 12:20 |
| 106 | (4) | | 39 | Movistar Team | + 12:32 |
| 107 | (7) | | 31 | Katusha Team | + 12:44 |
| 108 | (7) | | 18 | Burgos 2016 - Castilla y Leon | + 12:59 |
| 109 | (2) | | 22 | Andalucia Caja Granada | + 13:05 |
| 110 | (3) | | 30 | Androni Giocattoli | + 13:09 |
| 111 | (1) | | 26 | Topsport Vlaanderen - Mercator | + 14:05 |
| 112 | (13) | | 23 | Katusha Team | + 14:27 |
| 113 | (1) | | 21 | Orbea Continental | + 14:41 |
| 114 | (4) | | 22 | Topsport Vlaanderen - Mercator | + 16:19 |
| 115 | (2) | | 31 | Saur - Sojasun | + 17:22 |