| 1 | | 22 |  Tavfer-Measindot-Mortágua | 70 |
| 2 | | 28 |  Euskaltel - Euskadi | 53 |
| 3 | | 25 | Caja Rural - Seguros RGA | 33 |
| 4 | | 35 | Efapel | 28 |
| 5 | | 32 | Euskaltel - Euskadi | 27 |
| 6 | | 31 | Equipo Kern Pharma | 26 |
| 7 | | 35 | W52 / FC Porto | 25 |
| 8 | | 25 | Efapel | 21 |
| 9 | | 22 | Burgos - BH | 19 |
| 10 | | 21 | Burgos - BH | 19 |
| 11 | | 30 | Antarte - Feirense | 18 |
| 12 | | 30 | Radio Popular - Boavista | 17 |
| 13 | | 24 | Caja Rural - Seguros RGA | 13 |
| 14 | | 27 | Kelly / Simoldes - Udo | 13 |
| 15 | | 21 | Efapel | 9 |
| 16 | | 19 | | 8 |
| 17 | | 24 | | 8 |
| 18 | | 22 | Equipo Kern Pharma | 8 |
| 19 | | 28 | Louletano - Loulé Concelho | 7 |
| 20 | | 26 | Atum General / Tavira / Maria Nova Hotel | 7 |
| 21 | | 22 | Equipo Kern Pharma | 7 |
| 22 | | 20 |  ProTouch | 6 |
| 23 | | 25 | | 6 |
| 24 | | 23 | Equipo Kern Pharma | 6 |
| 25 | | 24 |  Nippo-Provence-Pts Conti | 6 |
| 26 | | 20 | ProTouch | 5 |
| 27 | | 23 |  Delko | 4 |
| 28 | | 27 | | 4 |
| 29 | | 25 | Equipo Kern Pharma | 3 |
| 30 | | 29 | Euskaltel - Euskadi | 2 |
| 31 | | 36 | Efapel | 2 |
| 32 | | 33 | Antarte - Feirense | 2 |
| 33 | | 30 | Louletano - Loulé Concelho | 1 |
| 34 | | 35 | Kelly / Simoldes - Udo | 1 |
| 35 | | 23 | ProTouch | 1 |
| 36 | | 26 | | 1 |
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